İzmir Kâtip Çelebi Üniversitesi İslami İlimler Fakültesi (İKÇÜ – İ.F.F), 13.08.2012 tarihinde kabul edilen ve 10.09.2012 tarihinde 28407 Sayılı Resmi Gazetede yayınlanan Bakanlar Kurulu Kararı ile kurulmuştur. 1 Nisan 2013 tarihinde fakültenin kurucu dekanlığına Necmettin Erbakan Üniversitesi öğretim üyesi Prof. Dr. Saffet KÖSE atanmıştır. Takip eden süreç içinde tüm anabilim dallarına yeterli sayıda öğretim üyeleri alımına gidilmiştir. Fakültemiz; 2014-2015 öğretim yılında 140 öğrencisi, 14 öğretim üyesi ve 7 araştırma görevlisiyle eğitim öğretime başlamıştır. 

17.03.2016 Tarihinde İzmir Kâtip Çelebi Üniversitesi İslami İlimler Fakültesine YÖK Genel Kurulunca ikinci kez atanmıştır. 2018 Yılı Nisan ayında İzmir Kâtip Çelebi Üniversitesi Rektörü olan Prof. Dr. Saffet KÖSE’nin yerine önce vekaleten, 24.01.2019 tarihinde de YÖK Genel Kurulunca asaleten Prof. Dr. Sıddık KORKMAZ atanmıştır. 01.06.2022 Yılında YÖK Genel Kurulunca ikinci kez İzmir Kâtip Çelebi Üniversitesi İslami İlimler Fakültesi Dekanlığına atanan Prof. Dr. Sıddık KORKMAZ 25.06.2022 tarihinde vefat etmesi ile önce vekaleten daha sonra 13.04.2023 tarihinden itibaren de Prof. Dr. Mehmet DİRİK, YÖK Genel Kurulunun 2023/17 sayılı kararı ile İslami İlimler Fakültesi Dekanı olarak atanmış olup halen görevine devam etmektedir. Fakültemizin adı, 18.05.2023 tarih ve 32194 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan 17 Mayıs 2023 tarih ve 2023/7290 sayılı Cumhurbaşkanı Kararı uyarınca "İlahiyat Fakültesi" olarak değiştirilmiştir.